Данное предупреждение связано с использованием PHP версии 5.3 или выше. В PHP 5.3 некоторые функции, параметры и возможности были отмечены как DEPRECATED (НЕИСПОЛЬЗУЕМЫЕ). В последующих версиях они будут удалены.
В частности, неиспользуемой возможностью стало использование конструкций вида: $instance = & new SimpleClass();